Ich meine mich dunkel daran zu erinnern, dass sogar [UIApplication openURL:] nicht aufgerufen wird, wenn in einem WebView auf einen Link geklickt wird. Das macht ja auch Sinn, sonst würde jeder eingebettete UIWebView direkt Safari öffnen.

URL-Aufrufe aus einem WebView kannst Du meines Erachtens nur mit einem eigenen URL-Schema abfangen.